ABC結 果RNA-seqのヒートマップ解析発現変動遺伝子のボルケーノプロット有意な変調パスウェイ図1 遺伝子発現情報に基づくULMSの特徴文献 4）より引用、改変あるprexasertib（10 mg/kg）もしくはDMSOを週2回計8回腹腔内投与した。腫瘍径を測定し、腫瘍サイズが2,000 mm3を超えた時点でsacrificeした。動物実験に関しても、国立がん研究センターの倫理委員会の承認を受けている（No.T18-009）。統計解析 実験結果は、平均（mean）±標準誤差（SEM）で示した。Rソフトウェア（ver.4.0.3）を用いて統計解析を行った。対応のない2群間の比較には、Welch’s t-testを使用した。コントロール群に対する3群間の比較には、Dunnett’s testを用いた。発現変動遺伝子を抽出する際のlog2（Fold Change）およびp値の算出には、DEseq2パッケージ（ver. 1.30.0）を使用した。p < 0.05の場合に、統計学的に有意な差があると判断した。RNA-seqに基づく新規治療薬開発 国立がん研究センターのバイオバンクの新鮮凍結組織を用いてRNA-seqを施行した。ヒートマップ解析により、ULMSとmyomaと遺伝子発現プロファイルは大きく異なることが示された（図1A）。ただ、6例のULMSのうち2例は（ULMS-3とULMS-6）は、myomaに近い性質を示しており、ESR1遺伝子やPGR遺伝子の発現高値より、臨床的に悪性度の低いULMSのサブタイプであることが示唆された。6例のULMSと3例のmyomaについて、DEseq2を用いて統計学的に比較し、ボルケーノプロットにより512個（ULMSにおいて発現上昇：387個、ULMSにおいて発現低下：125個）の発現変動遺伝子を同定した（図1B）。この512個の発現変動遺伝子について、IPAソフトウェアによりパスウェイ解析を行ったところ、Kinetochore Metaphase Signaling Pathway（p = 5.01E-24）、Mitotic Roles of Polo-Like Kinase（p = 1.58E-11）、and Cell cycle: G2/M DNA Damage Checkpoint Regulation（p = 2.51E-7）といった細胞周期に関わるパスウェイ44
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